«`html
ПротЕкс: улучшение прогнозирования функций белков с помощью глубокого обучения с повышенным извлечением
Прогнозирование функций белков: проблема и решение
Протеины выполняют разнообразные функции в организмах, и для биологии важно связать последовательности белков с их биологическими функциями. Это можно сделать с помощью онтологий, таких как термины Gene Ontology (GO), номера Enzyme Commission (EC) и семейства Pfam. Для этого используются вычислительные методы, включая методы на основе гомологии и глубокого обучения, такие как методы глубокого обучения, использующиеся для прямого прогнозирования функций из последовательностей. Одной из проблем является прогнозирование функций для новых классов белков и работа с последовательностями, которые не имеют сходства с известными последовательностями, известных как «тёмная материя» белковой вселенной.
ПротЕкс: метод для улучшения прогнозирования функций белков
ПротЕкс представляет собой метод прогнозирования функций белков, использующий экземпляры из базы данных для улучшения точности, надежности и обобщения к новым классам белков. Он объединяет методы на основе гомологии и методы глубокого обучения, используя инструменты, такие как BLAST, для извлечения положительных и отрицательных экземпляров и обучая нейронную модель для сравнения этих экземпляров с запросом.
Применение ПротЕкс в практике
ПротЕкс был оценен на нескольких наборах данных и показал улучшенные результаты по сравнению с предыдущими методами. Он также достиг состояния искусства на наборе данных Pfam, демонстрируя последовательную точность в классификации общих и редких семейств белков. Метод был предварительно обучен на парах последовательностей и дообучен с использованием архитектуры T5 Transformer.
Использование ИИ для вашего бизнеса
Если вы хотите улучшить свой бизнес с помощью ИИ, обращайтесь к нам. Мы поможем вам анализировать возможности применения автоматизации, определить ключевые показатели эффективности, подобрать подходящее решение и внедрить ИИ постепенно.
Попробуйте нашего AI ассистента в продажах AI Sales Bot, который поможет вам снизить нагрузку на первую линию и повысить эффективность вашего отдела продаж.
Подпишитесь на наш Телеграм-канал и следите за новостями о ИИ и событиями в Twitter @itinairu45358.
«`
