CelloType: Искусственный интеллект для сегментации и классификации клеток в пространственной омии.

 CelloType: A Transformer-Based AI Framework for Multitask Cell Segmentation and Classification in Spatial Omics

“`html

Сегментация и классификация клеток в пространственной омике

Сегментация и классификация клеток важны для анализа пространственных омник данных, которые дают уникальные знания о клеточных структурах и функциях тканей.

Современные технологии и проблемы

Недавние достижения в технологиях пространственной омии позволяют проводить анализ тканей с высокой разрешающей способностью. Однако традиционные методы, такие как Mesmer, Cellpose и CELESTA, имеют недостатки в вычислительной эффективности и консистентности. Это подчеркивает необходимость более продвинутых решений.

Преимущества трансформерных моделей

Хотя CNN улучшили сегментацию и классификацию изображений, модели на основе трансформеров, например, DINO и MaskDINO, показывают лучшие результаты в задачах обнаружения объектов и сегментации. Их адаптация к многослойным изображениям клеток еще требует изучения.

Модель CelloType

CelloType — это продвинутая модель, разработанная учеными из Университета Пенсильвании и Университета Айовы, позволяющая одновременно выполнять сегментацию и классификацию клеток. Она использует многозадачное обучение для повышения точности.

  • Модули CelloType:
  • Экстракция признаков на основе Swin Transformer для создания многоуровневых изображений.
  • DINO для обнаружения и классификации объектов.
  • MaskDINO для сегментации экземпляров.

CelloType продемонстрировала превосходные результаты на различных наборах данных, включая мультиплексированные флуоресцентные изображения и пространственную транскриптомику.

Почему CelloType лучше?

Модель CelloType показала более высокую точность по сравнению с Mesmer и Cellpose, особенно в задачах сегментации и классификации рака толстой кишки, благодаря ее способности одновременно выполнять обе задачи.

Внедрение ИИ в бизнесе

Чтобы ваша компания использовала ИИ, рассмотрите следующие шаги:

  • Анализируйте, как ИИ может изменить вашу работу.
  • Определите ключевые показатели эффективности (KPI) для улучшения.
  • Выберите подходящее ИИ решение и начните с небольшого проекта.
  • Расширяйте автоматизацию на основе полученного опыта.

Если вам нужны советы по внедрению ИИ, обратитесь к нам.

Дополнительные ресурсы

Следите за новостями о ИИ в нашем Телеграм-канале или на Twitter. Попробуйте AI Sales Bot для улучшения процесса продаж.

“`

Полезные ссылки: