ProTrek: Многофункциональная языковая модель для анализа последовательности, структуры и функции белков

 ProTrek: A Tri-Modal Protein Language Model for Advancing Sequence-Structure-Function Analysis

“`html

Протеиновые модели и их значение

Протеины — это важные молекулы жизни, которые участвуют во многих биологических процессах. Понимание их последовательности, структуры и функции (SSF) является ключевым в биохимии и разработке лекарств.

Проблемы существующих инструментов

Существующие инструменты, такие как BLAST и Foldseek, часто фокусируются на локальных выравниваниях, что ограничивает их способность к глобальному анализу. Кроме того, около 30% протеинов в UniProt не имеют аннотаций из-за различий в последовательностях.

Новые решения с помощью ИИ

Совсем недавно появились нейронные сети, которые помогают более точно аннотировать функции протеинов. Однако они не могут создавать подробные описания функций. Модели языка, такие как ChatGPT, продемонстрировали отличные результаты в обработке естественного языка, что открывает новые возможности в вычислительной биологии.

ProTrek: новый уровень анализа

ProTrek — это современная три-модальная модель, которая объединяет SSF. Она использует контрастное обучение для быстрого и точного поиска по девяти комбинациям SSF. ProTrek в 100 раз быстрее и точнее существующих инструментов и превосходит ESM-2 в предсказаниях.

Как работает ProTrek

Модель обучена на 40 миллионах пар “протеин-текст”, что позволяет ей находить протеины с похожими функциями, несмотря на различия в структуре. ProTrek также предлагает возможности нулевого извлечения и тонкой настройки, устанавливая новые стандарты в исследовании протеинов.

Преимущества ProTrek

  • Эффективный поиск по девяти комбинациям SSF.
  • Улучшение производительности в 30-60 раз по сравнению с предыдущими методами.
  • Более 100-кратное увеличение скорости и точности по сравнению с традиционными инструментами.

Как использовать ИИ в вашей компании

Если вы хотите, чтобы ваша компания развивалась с помощью ИИ, рассмотрите следующие шаги:

  • Проанализируйте, как ИИ может изменить вашу работу.
  • Определите ключевые показатели эффективности (KPI), которые хотите улучшить.
  • Выберите подходящее решение из множества доступных ИИ.
  • Внедряйте ИИ постепенно, начиная с небольших проектов.

Получите помощь и советы

Если вам нужны советы по внедрению ИИ, пишите нам в Телеграм. Следите за новостями о ИИ в нашем Телеграм-канале.

Попробуйте AI Sales Bot — он поможет вам отвечать на вопросы клиентов и генерировать контент для отдела продаж.

Узнайте, как ИИ может изменить ваши процессы с решениями от AI Lab. Будущее уже здесь!

“`

Полезные ссылки: