Absci Bio представила IgDesign: новый подход к дизайну антител с использованием глубокого обучения

 Absci Bio Releases IgDesign: A Deep Learning Approach Transforming Antibody Design with Inverse Folding

“`html

Разработка антител с высокой специфичностью и сродством

Создание антител, которые эффективно связываются с различными терапевтическими антигенами, является важной задачей в разработке лекарств. Существующие методы сталкиваются с трудностями в генерации областей, определяющих комплементарность (CDRs), особенно переменной области тяжелой цепи CDR3 (HCDR3).

Проблемы существующих моделей

Современные вычислительные модели, такие как ProteinMPNN и AntiFold, используют генеративные подходы для предсказания последовательностей антител. Однако их практическое применение ограничено из-за недостатка экспериментальной проверки и трудностей в проектировании нескольких CDR как единого целого. Эти модели требуют тщательно подобранных наборов данных, что ограничивает их масштабируемость и эффективность.

Решение от Absci Bio: IgDesign

IgDesign — это новый подход на основе глубокого обучения, который решает вышеупомянутые проблемы. Он использует контекстные данные, такие как последовательности антигенов и каркас антител (FWR), для создания оптимизированных CDR3 и полных CDR тяжелой цепи. Модель отличается способностью проектировать высокоаффинные связывающие молекулы, которые были проверены в широкомасштабных испытаниях.

Преимущества IgDesign

  • Улучшенная масштабируемость и общая применимость.
  • Высокие показатели успеха в экспериментальных условиях.
  • Создание антител с сродством, сравнимым или лучшим, чем у клинически проверенных образцов.

Как это работает

Исследователи собрали наборы данных из SAbDab и PDB, чтобы избежать утечек данных. Модель была предварительно обучена на общих белковых данных и затем дообучена на комплексах антител-антигенов. Для каждого антигена было сгенерировано и протестировано 100 HCDR3 и 100 HCDR123.

Результаты

IgDesign показал превосходные результаты по всем тестируемым антигенам. Антитела, созданные с помощью IgDesign, продемонстрировали значительно более высокие показатели связывания по сравнению с базовыми значениями.

Преимущества внедрения ИИ в вашу компанию

Если вы хотите развивать свою компанию с помощью ИИ, следуйте этим шагам:

  • Определите, как ИИ может изменить вашу работу.
  • Выберите ключевые показатели эффективности (KPI), которые хотите улучшить с помощью ИИ.
  • Подберите подходящее ИИ-решение.
  • Внедряйте ИИ постепенно, начиная с небольших проектов.

Контакт для получения советов

Если вам нужны советы по внедрению ИИ, пишите нам в Telegram. Следите за новостями о ИИ в нашем Telegram-канале или в Twitter.

Попробуйте AI Sales Bot

Этот ИИ-ассистент в продажах помогает отвечать на вопросы клиентов и генерировать контент для отдела продаж. Узнайте, как ИИ может изменить ваши процессы с решениями от AI Lab на itinai.ru.

“`

Полезные ссылки: