“`html
VirtuDockDL: Платформа для ускоренного открытия лекарств с использованием глубокого обучения
Открытие новых лекарств — это дорогостоящий и длительный процесс, в котором высокий процент неудач. Обычно из миллиона проверенных соединений только одно оказывается жизнеспособным. Современные технологии высокопроизводительного скрининга (HTS и uHTS) позволяют быстро тестировать большие библиотеки соединений, что помогает фармацевтическим и биотехнологическим компаниям исследовать больше химических соединений и новых биологических мишеней.
Проблемы и решения
Несмотря на достижения технологий, остаются проблемы, такие как ограниченные прорывы в определении новых мишеней для лекарств и вопросы качества данных. Здесь на помощь приходят методы машинного обучения (ML) и глубокого обучения (DL), которые предлагают ценные решения, улучшая процесс открытия лекарств через анализ данных и предсказательные возможности.
Что такое VirtuDockDL?
VirtuDockDL — это платформа на основе Python, разработанная исследователями из различных университетов, использующая глубокое обучение для упрощения открытия лекарств. Платформа применяет графовые нейронные сети (GNN) для предсказания эффективности соединений, достигая 99% точности на наборе данных HER2, что превосходит такие инструменты, как DeepChem и AutoDock Vina.
Как работает VirtuDockDL?
VirtuDockDL предлагает автоматизированный процесс, который включает в себя построение молекулярных графов, виртуальный скрининг и кластеризацию соединений. Это позволяет эффективно определять потенциальные лекарства и продвигать исследование в области фармацевтики на основе ИИ.
Платформа преобразует молекулярные данные в графовые представления и использует архитектуру GNN для обучения сложным структурным взаимосвязям внутри молекул. Это позволяет предсказывать свойства, такие как молекулярная активность или связывающая способность.
Преимущества VirtuDockDL
- Высокая точность предсказаний (97.79%) на основе активных и неактивных молекул VP35.
- Идентификация 146 потенциальных кандидатов из баз данных ZINC и PubChem.
- Поддержка уточнения структуры белка и связывания лиганда с использованием AutoDock Vina.
- Простота использования благодаря удобному интерфейсу.
Заключение
VirtuDockDL — это эффективный инструмент для ускоренного открытия лекарств, использующий глубокое обучение и графовые нейронные сети. Он демонстрирует выдающиеся результаты в предсказании связывающей способности и может быть использован для разработки ингибиторов для различных заболеваний. Платформа сочетает в себе автоматизацию и удобный интерфейс, что делает ее ценным решением для фармацевтических исследований.
Если вы хотите, чтобы ваша компания развивалась с помощью искусственного интеллекта (ИИ), используйте VirtuDockDL. Определите, как ИИ может изменить вашу работу, и начните с небольших проектов. Для получения дополнительных советов по внедрению ИИ, свяжитесь с нами.
“`
